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1.Imagem marcado/desmarcadoMOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; GARCIA, A. A. F. Comparação dos algoritmos delineação rápida em cadeia e seriação, para a construção de mapas genéticos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 4, p. 505-512, abr. 2008 Título em inglês: Comparison of algorithms rapid chain delineation and seriation, for the construction of genetic linkage maps.

Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, M. A.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; BORTOLATTO, N.; SCHIAVON, A.; HUNGRIA, M. Mapping of QTLs associated with biological nitrogen fixation traits in soybean. Hereditas, Lund, v. 150, n. 2-3, p. 17-25, 2013.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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3.Imagem marcado/desmarcadoGAZAFFI, R.; MARGARIDO, G. R. A.; PASTINA, M. M.; MOLLINARI, M.; GARCIA, A. A. F. A model for quantitative trait loci mapping. Tree Genetics & Genomes, v. 10, p. 791-801, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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4.Imagem marcado/desmarcadoLARA, L. A. DE C.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; CHIARI, L.; GARCIA, A. A. F. Modeling the variance-covariance matrix of genetic and residual effects in a Panicum maximum genome wide selection experiment. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON QUANTITATIVE GENETICS, 5., Madison, Wisconsin, USA, 2016. Proceedings... Madison, Wisconsin, USA: ICQG, 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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5.Imagem marcado/desmarcadoMARGARIDO, G. R. A.; PASTINA, M. M.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. Multi-trait multi-environment quantitative trait loci mapping for a sugarcane commercial cross provides insights on the inheritance of important traits. Molecular Breeding, Dordrecht, v. 35, n. 175, p. 1-15, 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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6.Imagem marcado/desmarcadoALVES, R. M.; GARCIA, A. A. F.; CRUZ, E. D.; FIGUEIRA, A. Seleção de descritores botânico-agronômicos para caracterização de germoplasma de cupuaçuzeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 38, n. 7, p. 807-818, jul. 2003. il.

Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Unidades Centrais.

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7.Imagem marcado/desmarcadoROSÁRIO, M. F.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Descrição fenotípica das características de desempenho da população CTCT delineada para mapeamento de QTLs em galinha. In: CONFERÊNCIA APINCO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2007, Santos, SP. Anais... Campinas: FACTA, 2007. Trabalhos de pesquisa. p. 162. Projeto n. 01.02.102.10-10.

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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8.Imagem marcado/desmarcadoROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Genotypic characterization of microsatellite markers in broiler and layer selected chicken lines and their reciprocal F1s Scientiae Agrícola, v.66, n.2, p.150-159, 2009. Disponível em: . Acesso em: 12 fev. 2010 Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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9.Imagem marcado/desmarcadoFAVERO, A. P.; MORAES, S. A. de; GARCIA, A. A. F.; VALLS, J. F. M.; VELLO, N. A. Characterization of rust, early and late leaf spot resistance in wild and cultivated peanut germplasm. Scientia Agricola, v.66, n. 1, p.110-117, 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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10.Imagem marcado/desmarcadoFÁVERO, A. P.; MORAES, S. A. de; GARCIA, A. A. F.; VALLS, J. F. M.; VELLO, N. A. Caracterização da resistÊncia à ferrugem, mancha preta e mancha castanha em germoplasma silvestre e cultivado de amendoim. Scientia Agricola, v. 66, n.1, p. 110-117, jan./fev., 2009.

Biblioteca(s): Embrapa Algodão.

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11.Imagem marcado/desmarcadoROSÁRIO, M. F.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Busca in silico por genes associados ao desempenho de frangos. In: CONFERÊNCIA APINCO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2007, Santos, SP. Anais... Campinas: FACTA, 2007. Trabalhos de pesquisa. p. 161. Projeto n. 01.02.102.10-10.

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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12.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, C. M.; FERRÃO, L. F. V.; ROHR, A.; PINHEIRO, N. L.; PEREIRA, A. da S.; GARCIA, A. A. F. Population structure of potato breeding germplasm from Embrapa-Brazil assessed with single nucleotide polymorphism (SNP) markers. In: CONGRESO DE LA ASOCIACION LATINOAMERICANA DE LA PAPA - ALAP, 28., 2018, Cusco, Peru. Abstract Book 10th: Congress: Biodiversity, Food Security and Business. Instituto Nacional de Innovación: Agraria-INIA. Cusco, Perú, 2018. p. 123

Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado.

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13.Imagem marcado/desmarcadoBRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.

Biblioteca(s): Embrapa Cerrados.

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14.Imagem marcado/desmarcadoFERRÃO, L. F. V.; FERRÃO, R. G.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; GARCIA, A. A. F. A mixed model to multiple harvest-location trials applied to genomic prediction in Coffea canephora. Tree Genetics & Genomes, v. 13, n. 95, 2017.

Biblioteca(s): Embrapa Café.

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15.Imagem marcado/desmarcadoFERRÃO, L. F. V.; FERRÃO, R. G.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; GARCIA, A. A. F. Mixed model to multiple havest-location trial applied to genomic prediction in Coffea canephora. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Café.

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16.Imagem marcado/desmarcadoROSA, J. R. B. F.; SILVA, R. R.; PASTINA, M. M.; BARRETO, F. Z.; BALSALOBRE, T. W. A.; SOUZA, A. P.; CARNEIRO, M. S.; GARCIA, A. A. F. Estimation of linkage disequilibrium on a Brazilian collection of sugarcane (Saccharum spp.) genotypes from AFLP, SSR and EST-SSR data. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 54.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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17.Imagem marcado/desmarcadoVIGNA, B. B. Z.; JUNGMANN, L.; ALLEONI, G. C.; VALLE, C. B. do; FEIJO, G. L. D.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. Análise da segregação de locos microssatélites em uma população F1 segregante de Brachiaria humidicola hexaplóide. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 176

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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18.Imagem marcado/desmarcadoQUEZADA, M.; PASTINA, M. M.; RAVEST, G.; SILVA, P.; VIGNALE, B.; CABRERA, D.; HINRICHSEN, P.; GARCIA, A. A. F.; PRITSCH, C. A first genetic map of Acca sellowiana based on ISSR, AFLP and SSR markers. Scientia Horticulturae, v. 169, p. 138-146, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo.

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19.Imagem marcado/desmarcadoFERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. de C.; CHIARI, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de. The first genotyping by sequencing in an interespecific population of Urochloa decumbens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 104

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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20.Imagem marcado/desmarcadoROSÁRIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. Desvendando as causas da correlação entre características de desempenho e rendimento de carcaça na galinha: ligação x pleiotropia. In: CONFERÊNCIA APINCO 2008 DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2008, Santos. Trabalhos de pesquisa avícola. Campinas: FACTA, 2008. p. 205. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.

Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.

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Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Milho e Sorgo.
Data corrente:  09/09/2014
Data da última atualização:  23/05/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  GAZAFFI, R.; MARGARIDO, G. R. A.; PASTINA, M. M.; MOLLINARI, M.; GARCIA, A. A. F.
Afiliação:  MARIA MARTA PASTINA, CNPMS.
Título:  A model for quantitative trait loci mapping.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  Tree Genetics & Genomes, v. 10, p. 791-801, 2014.
DOI:  10.1007/s11295-013-0664-2
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Quantitative trait loci (QTL) mapping is an important approach for the study of the genetic architecture of quantitative traits. For perennial species, inbred lines cannot be obtained due to inbreed depression and a long juvenile period. Instead, linkage mapping can be performed by using a full-sib progeny. This creates a complex scenario because both markers and QTL alleles can have different segregation patterns as well as different linkage phases between them. We present a two-step method for QTL mapping using full-sib progeny based on composite interval mapping (i.e., interval mapping with cofactors), considering an integrated genetic map with markers with different segregation patterns and conditional probabilities obtained by a multipoint approach. The model is based on three orthogonal contrasts to estimate the additive effect (one in each parent) and dominance effect. These estimatives are obtained using the EM algorithm. In the first step, the genome is scanned to detect QTL. After, segregation pattern and linkage phases between QTL and markers are estimated. A simulated example is presented to validate the methodology. In general, the new model is more effective than existing approaches, because it can reveal QTL present in a full-sib progeny that segregates in any pattern present and can also identify dominance effects. Also, the inclusion of cofactors provided more statistical power for QTL mapping.
Palavras-Chave:  Arquitetura genética.
Thesagro:  Genética; Progênie.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPMS26153 - 1UPCAP - DD
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